Nach dem Tod von Bruder Klaus wuchs der Pilgerstrom. 1501 wurde diese grössere Pilgerkapelle an der Melchaa gebaut und 1504 – wie die Obere Kapelle – zu Ehren der Mutter Gottes, Maria Magdalena, des heiligen Kreuzes und der 10‘000 Ritter geweiht. Die Kapelle ist eines der schönsten Beispiele spätgotischer Baukunst und birgt einen reichen Freskenschmuck.
Die Malereien im Chor gehen in die Bauzeit zurück.
An den Seitenwänden sind Szenen aus dem Leben von Bruder Klaus von Flüe sowie die Passion Christi, gemalt im frühen 16. Jh., zu sehen.
Die Rückwand ziert das monumentale Votivgemälde in der Tradition der Ex-Votos. Vordergründig zeigt es, wie die Schweiz im Ersten Weltkrieg dank der Fürbitte von Bruder Klaus verschont blieb.
Entwurf: Robert Durrer
Ausführung: Robert Durrer, Albert Hinter, Hans von Matt
Auftraggeber: Schweizerischer Katholischer Volksverein
Friedenslicht
Seit 2020 brennt das Friedenslicht aus Bethlehem ganzjährig neben dem Bruder-Klausen-Altar in der Kapelle. Jährlich wird es in Advent neu entzündet.